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天然藥物提取液中常含有極性不問的各種化學成分，系統(tǒng)溶劑分離法就是根據(jù)它們在不同極性溶劑中溶解度的差異，選用3~4種不同極性的溶劑組成溶劑系統(tǒng)，由低極性到高極性分步對濃縮后的總提取物進行初步分離。
水浸膏或乙醇浸膏常常為膠狀物，難以均勻分散在低極性溶劑中，故不能提取完全，可拌入適量惰性填充劑，如硅藻土或纖維粉等，然后低溫或自然干燥，粉碎后，再以選用溶劑依次提取，使總提取物中各組成成分，依其在不同極性溶劑中溶解度的差異而得到分離。例如粉防己乙醇浸膏，堿化后可利用乙mi溶出溶性生物堿，再以冷苯處理溶出粉防己堿，與其結構類似的防己諾林堿比前者少—個甲基而有一酚羧基，不溶于冷苯而得以分離。利用中草藥化學成分在不同極性溶劑中的溶解度進行分離純化，是最常用的方法。
在中草藥提取溶液中加入另一種溶劑，析出其中某種或某些成分，或析出其雜質，也是一種溶劑分離的方法。中草藥的水提液中常含有樹膠、黏液質、蛋白質、糊化淀粉等，可以加入一定量的乙醇，使這些不溶于乙醇的成分自溶液中沉淀析出，而達到與其他成分分離的目的。例如從中草藥提取液中除去這些雜質，如從白及水提取液中獲得白及膠，可采用加乙醇沉淀法；從新鮮括樓根汁中提取天花粉素，可滴入丙酮使其分次沉淀析出。目前，提取多糖及多肽類化合物，多采用水溶解、濃縮、加乙醇或丙酮析出的辦法。此外，也可利用其某些成分能在酸或堿中溶解，又在加堿或加酸改變溶液的PH后，使成不溶物而析出以達到分離的目的。
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